Trong khi HAGL đi vào lịch sử với 2 đội đoạt vé dự VCK U19 Quốc gia thì Hà Nội FC với tư cách là ĐKVĐ lại bất ngờ bị loại ngay từ vòng đấu bảng.
 
Vòng loại U19 Quốc gia 2020 đã chính thức khép lại với các trận đấu cuối cùng vào ngày 11/6. 1 ngày sau khi HAGL 1 tạo thế áp đảo ở bảng C, đến lượt HAGL 2 cũng đoạt vé dự VCK. 
 
Đội bóng với các cầu thủ chủ yếu 16, 17 tuổi có được trận hòa 3-3 và kết thúc vòng loại với vị trí nhì bảng D, vừa đủ để có mặt ở VCK với tư cách một trong những đội nhì bảng xuất sắc nhất. 
 
Trong khi đó, bất ngờ đã xảy ra tại bảng A khi ĐKVĐ Hà Nội FC chỉ kết thúc với vị trí thứ 3 sau trận thua 0-1 trước PVF. Xét cả quá trình vòng loại, Hà Nội FC đã chơi không tệ khi chỉ thua duy nhất 1 trận nhưng đó lại là trận thua mang tính "chí mạng" khiến đội trẻ của ĐKVĐ V-League không thể có mặt tại VCK của giải đấu U19 Quốc gia. 
 
Một số đội bóng trẻ tiềm năng khác cũng nối bước Hà Nội FC vắng mặt ở VCK U19 Quốc gia là Đà Nẵng và Thanh Hóa. Trong khi đó, những SLNA, Bình Dương hay CLB TPHCM đã ghi tên mình đến giải đấu được tổ chức ở trung tâm đào tạo bóng đá trẻ PVF. 
 
VCK giải bóng đá U19 quốc gia 2020 diễn ra từ ngày 19/6 đế 28/6 tại Trung tâm bóng đá PVF (Hưng Yên). 8 đội cụ thể có mặt ở VCK là: PVF, Sông Lam Nghệ An, Hoàng Anh Gia Lai 1, CLB TP.HCM, Becamex Bình Dương, Công an Nhân dân, An Giang và Hoàng Anh Gia Lai 2.